Postdoc (m/w/d)

Das Universitätsklinikum Knappschaftskrankenhaus Bochum sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt einen:

Postdoc (m/w/d)

für Spatial Proteomics Analysen viraler Infektion

in Vollzeit/Teilzeit

Das Universitätsklinikum Knappschaftskrankenhaus Bochum gehört zu den Universitätskliniken der Ruhr- Universität Bochum und zum Verbund der Knappschaftskliniken in Trägerschaft der Knappschaft-Bahn-See.

Unsere über 100jährige Tradition als Akteur des Gesundheitswesens und unser dauerhaftes Engagement in die Förderung und Entwicklung innovativer Medizin sind die Basis unserer zukünftigen Entwicklung. Wir freuen uns, wenn Sie diese Entwicklung mit uns heute und in Zukunft gestalten.  Als Arbeitgeber bietet Ihnen sowohl unser Haus, wie auch unser Verbund, eine partnerschaftliche und respektvolle Arbeitsatmosphäre in einem modernen, innovativen und stetig wachsenden Krankenhausverbund. Neben einem modernen Arbeitsumfeld bieten wir Ihnen individuelle Karriere- und Entwicklungsmöglichkeiten innerhalb des gesamten Verbundes, die durch die Vereinbarkeit von Privat- und Berufsleben unterstrichen werden.

Die Arbeitsgruppe Clinical Proteomics unter der Leitung von Prof. Dr. Barbara Sitek ist in der Klinik für Anästhesiologie, Intensivmedizin und Schmerztherapie am UK-KKB verortet und arbeitet eng mit dem Medizinischen Proteom-Center (MPC) der Ruhr-Universität Bochum (RUB) zusammen. Dadurch wird die Brücke zwischen beiden Einrichtungen geschlagen mit dem Ziel klinische Expertise und interdisziplinäre Grundlagenforschung zu verknüpfen, um Krankheiten besser zu verstehen, deren Verläufe vorherzusagen und Patient*innen zielgerichteter behandeln zu können.

Ein Schwerpunkt der Forschungsgruppe Clinical Proteomics ist die Bearbeitung virologischer Fragestellungen. Hierzu werden modernste Methoden auf Basis Flüssigchromatographie-gekoppelter Tandem-Massenspektrometrie (LC-MS/MS) verwendet. Das hier ausgeschriebene Projekt wird in Zusammenarbeit mit der Abteilung für Molekulare & Medizinische Virologie der RUB bearbeitet.

Es sollen Host-Virus-Interaktionen mit subzellulärer räumlicher Auflösung in ihrem zeitlichen Verlauf untersucht werden. Hierzu werden Zellen im Modell mit SARS-CoV-2 infiziert, mittels Ultrazentrifugation fraktioniert und massenspektrometrisch analysiert. Zusätzlich werden post-translationale Modifikationen gemessen und diese Datenebenen in die Analysen integriert. Es werden mehrere Quantifizierungsstrategien (DIA, TMT) sowie verschiedene proteinbiochemische Methoden angewandt (z.B. off-line Fraktionierung mittels high pH-RP-HPLC). Zur Datenauswertung werden R-Pakete verwendet zu deren Verwendung praktische Erfahrung mit R erforderlich ist.

Das Ziel des Forschungsvorhabens ist es, die räumliche und zeitliche Dynamik der SARS-CoV-2-Infektion und die gegenseitige Beeinflussung von Host und Virus besser zu verstehen. Die Erkenntnisse sollen Ansatzpunkte zur Entwicklung neuer antiviraler Therapien liefern und in Folgeprojekte münden.

Ihre Aufgaben:

• Planung und Durchführung komplexer Experimente mit einer Vielzahl genutzter Methoden
• Auswertung komplexer Datensätze mit dem Ziel der Integration verschiedener Datenebenen
• Mitarbeit an Folgeanträgen und Publikationen